Một tình huống tranh cãi đã xảy ra ở trận U22 Việt Nam vs U22 Singapore khi một cầu thủ Singapore vào bóng thô bạo bằng gầm giày với Phan Tuấn Tài nhưng không phải nhận bất cứ tấm thẻ nào.

Tình huống xảy ra ở phút 27 của trận đấu khi tỷ số đang là 0-0. Trong một pha lên bóng chếch bên cánh phải của U22 Singapore, số 16 của Singapore là Fathullah Rahmat đẩy bóng hơi dài, tạo điều kiện cho Tuấn Tài của U22 Việt Nam cướp được bóng. 

Tuy nhiên, Rahmat sau đó đã có pha bóng rất xấu chơi khi đạp thẳng gầm giày vào chân Tuấn Tài, khiến hậu vệ của U22 Việt Nam nằm sân vì đau đơn. Những pha quay chậm sau đó cho thấy Rahmat rõ ràng đã phạm lỗi nguy hiểm với Tuấn Tài và xứng đáng phải nhận thẻ đỏ trực tiếp.

Nhưng đáng ngạc nhiên là trọng tài chính trận đấu này lại bỏ qua tình huống, thậm chí còn không rút ra bất cứ tấm thẻ nào cho Rahmat. Đây rõ ràng là một lỗi nặng của cả Rahmat lẫn trọng tài chính, khiến các CĐV Việt Nam bức xúc. 

 Trong trận U22 Campuchia gặp Timor Leste tối 29/4, tổ trọng tài cũng có quyết định gây tranh cãi.

Phút 60, số 10 của U22 Timor Leste, Mouzinho thoát xuống ở vị trí trống trải nhưng bị thủ môn Reth Lyheng băng ra cản phá bằng... tay.

Cầu thủ Timor Leste phản ứng dữ dội và yêu cầu trọng tài rút thẻ đỏ cho thủ môn U22 Campuchia vì lỗi chơi bóng bằng tay ngoài vòng cấm. Video quay chậm cũng chỉ rõ lỗi của Lytheng. Tuy nhiên, trọng tài chính Jamali lại không rút thẻ. Vị trọng tài biên đứng ngay gần đó cũng không có bất kỳ phản ứng nào.

Tại SEA Games 32, VAR không được sử dụng.